Cmentarz twierdzy Modlin został założony podczas wojen napoleońskich. Obrońcy twierdzy Modlin z 1813 roku byli pierwszymi pochowanymi żołnierzami. Podczas pierwszej wojny światowej pochowano tu poległych w walce żołnierzy armii niemieckiej i rosyjskiej. W 1920 roku na tym cmentarzu spoczęli również żołnierze wojny polsko-bolszewickiej, a także ci, którzy zmarli w szpitalu wojskowym w Modlinie. Pochowano tu również obrońców twierdzy Modlin z 1939 roku, żołnierzy niemieckich z lat 1939–1944, a także żołnierzy innych narodowości z różnych armii, którzy zginęli w Polsce w XIX i XX wieku. Cmentarz został całkowicie zniszczony w 1945 roku. W latach 1995–97 teren został częściowo odbudowany. Odtworzono kwatery żołnierzy polskich z 1920 roku, zbiorowe mogiły z 1939 roku oraz kwatery żołnierzy armii niemieckiej z lat 1939–44. Cmentarz wojskowy twierdzy Modlin jest wpisany do rejestru zabytków.
Wśród pochowanych tylko jedno nazwisko wydawało się mieć francuskie pochodzenie (Alfred PONGE). Po dokładnych poszukiwaniach okazało się, że chodziło o 16-letniego polskiego ucznia zmarłego podczas wojny polsko-bolszewickiej.